Биостатистика, фармакокинетика и клинические исследования.
Часто возникает простая статистическая задача – есть две группы и надо выполнить анализ: проверить есть ли различия между изменением которые произошли от скрининга до какой-либо другой временной точки. Что для этого делается? Правильно! Если у нас “широкий” датасет, то просто вычисляем новую переменную типа P1 – P2 и считаем обычным GLM (или даже T-тестом, не…
Код для определения доверительных интервалов исследования биоэквивалентности для T-R контраста. С учетом структуры данных использована модель (ALL FIXED): Y = Subject(Sequence*Stage) + Period(Stage) + Formulation + Sequence + Sequence(Stage) + Stage Фактор: Formulation(Stage) – не включен. Альфа = 0.05 (должна быть переопределена в зависимости от использованного алгоритма). SPSS GLM: 123456789GLM LnVar BY Period Sequence Formulation…
Ранее уже писал, что есть некоторое несоответствие SPSS и SAS по расчетам степеней свободы. Не могу точно сказать – какие причины приводят к различиям, но они есть. Для иллюстрации можно рассмотреть доступный датасет, который входит в состав Phoenix WinNonlin RAEBE Template – Example Data EMA 618604 2008 Rev 7.xls Выполним код SAS для этого датасета:
Ниже представлен код для IBM SPSS для расчета 90% доверительных интервалов исследования биоэквивалентности. Код соответствует референсному коду SAS при условии положительной матрицы Гессе. Т.к. FDA допускает использование COVTYPE – CSH (Heterogeneous Compound Symmetry), а FA0() в SPSS отсутствует, то используется именно этот тип. Надо отметить, что в SPSS при использовании GENLINMIXED структура CSH – недоступна,…
Сравнение пропорций является одним из основных методов описания данных и проверки статистических гипотез. И наиболее ценным является интервальная оценка методом построения доверительных интервалов. Гипотезы эффективности, не меньшей эффективности, эквивалентности могут быть проверены с помощью построения доверительных интервалов. Но если мы посмотрим на набор инструментов IBM SPSS, то нам может сперва стать немного дурно, так как…
Расширение для IBM SPSS реализует интерфейс для библиотеки PowerTOST среды вычислений R Project. Расширение синтаксиса с помощью команды POWERTOST. Версия: 1.0.0
IBM SPSS дает возможность разработки собственных команд синтаксиса. Это средство совместно с применением Python и R Project дает очень широкие возможности применения и расширения функционала SPSS (и это действительно важно, ведь SPSS не дает, к примеру, человеческим образом получить доверительный интервал для разности пропорций). А если вы захотите найти руководство, то задав поисковику множество запросов…
В IBM SPSS для расчтета доверительных интервалов разницы лог-преобразованных параметров используется процедура GLM. За основу был взять код предложенный пользователем Oiinkie на форуме bebac.at Небольшая модификация связана с явным указанием фактора для контраста: /CONTRAST(Trt)=Simple(1) – требуется с вниманием указать какой уровень фактора будет референсным. Дополнительный участок кода использует результаты таблицы контрастов для вычисления искомых доверительных…
Допустим необходимо большому количеству переменных присвоить значения категорий. К примеру есть переменная содержащая значения 1 и 0, где 1 – да, 0 – нет. Если таких переменных очень много и у каждой свои метки, то присвоение таких меток может занять очень длительное время, но не в том случае если информация о метках уже содержится в…
Не редко бывает, что необходимо присвоить метки большому количеству переменных. И хорошо если эти метки где-либо уже записаны. К примеру в таблице, где в виде переменных (полей/столбцов) содержатся данные переменная->метка. Получается такого рода словарь. Делать это вручную с помощью copy/paste не хочется, да и можно сделать ошибку, а переменных может быть очень много. Хорошо, что…